「二二八·0306」陈列位于博物馆2层展厅，通过实物、照片、模型和互动装置等，再现「二二八事件」的历史情境，帮助参观者理解并探索这一事件的特殊性、争议性和历史意义。
1947年2月27日，国民党警员在台北开枪误杀一名市民，次日（2月28日）台北市民游行至「行政长官公署」要求交出罪犯，但遭到士兵射击，事态迅速扩大，演变成席卷全岛的武装暴动。整个事件持续近半个月，由于国民党的镇压，最终造成超过1万人死亡。
高雄市立历史博物馆建筑曾是市政府大楼，二二八事件期间是「高雄镇压」的爆发地，国民党军队以机枪和手榴弹对楼内群众进行无差别攻击。展厅中央陈列有这一场景的复原模型。
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