南山大学人类学博物馆常设展按照藏品来源分为4个展区，展厅布置为开放型的陈列，大多数展品参观者们都可以触摸感受。
第1展区展示南山大学的前身「神言修道会」的神父们收集的资料，涵盖欧洲旧石器时代的石器及绳文时代的考古资料等。
第2展区是南山大学所属教职员工及学生们在调查研究过程中搜集的资料，内含南山大学调查团在1960年代收集的巴布亚新几内亚民族志、名古屋市高藏遗迹及瑞穗遗迹中发掘出的弥生时代陶器等。
第3展区呈现其他机构捐赠的资料，如上智大学泰国西北调查团在1960年代后期至1970年代收集的泰国北部山岳地区少数民族的服饰珠宝等民族资料。
第4展区是该馆在1983年开始收集的昭和年代生活用品，以「商品目录」的形式呈现，展示昭和三十年至四十年代的日本人日常生活。
绳文时代土器
部分展厅
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