国立科学博物馆是日本最早建立的综合国立博物馆，目前藏品数量超过470万件，位于东京上野的主馆共有2个常设展馆「地球馆」和「日本馆」。
地球馆常设展
本展共设10个展区，展出古生物、哺乳动物、鸟类、鱼类等实物标本，辅以影像及互动装置，展现地球生命的起源及演变。重要展品包括寒武纪至二叠纪的多件三叶虫化石标本、距今7000万年前的特暴龙骨骼标本、巨犀标本等。
霸王龙标本
抹香鲸与亚洲象的骨骼标本
除生物相关展区外，馆内还设有地球史展区、地球环境展区、科技探索地球展区以及亲子互动展区，帮助人们更全面地认识地球。
万年自鸣钟，田中久重，明治时代
日本馆常设展
本展共分为5部分，「日本列岛的起源」「日本列岛的成长」「列岛上的生物」三部分展出不同地区的动植物及土壤标本，直观呈现日本的地形地质对本国气候、季节与自然环境的影响。
忠犬八公标本
「日本人与自然」展出绳纹时代至今人们的生活用具，展现了日本人与自然和谐相处的过程。「探索自然」部分的展品有日本最早的地震仪「米尔恩水平摆地震波检测仪」，以及江户时代的「换算天平秤」等。
特罗顿天体望远镜，1880年
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