澳门科学馆共有12个常设展，主题包括太空科学、儿童乐园、儿童科学、科学快乐、机械人、声学、物理力学、dna、环保、运动健康、运动竞技、电学及电磁学。
太空科学厅：以太空科学学院的形式，让参观者通过互动展品学习各种探索太空的基础知识。
儿童乐园厅：仅供身高1.2米以下的儿童及其家人进行亲子活动，为小朋友提供一个安全舒适的探索空间。
儿童科学厅：特别为小学生设立，以任务式的动手游戏引导儿童学习各种科学知识。小朋友可以自行探索与水有关的展项、以及4组专题展台。
科学快车厅：分为「科学快车2009」、中央车站、4个科学启发展区，介绍不同的科学家及其科学发现。
机械人厅：展厅的深邃山洞中隐藏着一个机械人工厂，里面有全自动操作的机械人，不定时展示最先进机械人的技术。参观者可以通过动手实践，将零部件组装成机械人。
声学厅：展品内容围绕声波、频率、声音传递、乐器的作用原理，展出各种大型乐器，人们可以在演奏这些乐器的过程中领会其工作原理。
物理力学厅：以物理学中的经典力学原理为主题，分为杠杆原理、自由落体、牛顿定律、核子变化等课题，通过趣味性的互动展品深入浅出地展示自然界的现象及物理规则。
dna 厅：展示以 dna 及生物科技为主题的全新互动展品，让参观者从中学习细胞、基因、染色体、dna 分析及复制技术等知识。
环保厅：介绍目前可实行的环保方法，包括重用、循环、减少、替代，宣传节约自然资源的环保理念。
运动健康厅：让观者认识到运动的必要性及个人的身体强度，并设专题展区详细介绍体操这项运动。
运动竞技厅：透过互动装置介绍一些运动科学方面的研究，以半个篮球场的形式演示现时动作捕捉系统的特性。
电学及电磁学展厅：展现对电流与磁性研究作出重要贡献的科学家以及他们建立的科学定律，介绍生活用电、用电安全的知识，以及展示直流电与交流电、导体和绝缘体等。
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