山西博物院的基本陈列以「晋魂」为主题，分为历史和艺术两部分，共展出4400件文物。历史部分位于主馆2、3层，包括文明摇篮、夏商踪迹、晋国霸业、民族熔炉、佛风遗韵、戏曲故乡、明清晋商等7个专题。
一、文明摇篮
山西地处黄河中游，是华夏文明发源地之一。山西境内迄今已发现300多处旧石器时代文化遗存和2000多处新石器时代文化遗存，其中西侯度遗址可以追溯至180万年前，是中国古人类用火的最早遗存。
彩陶罐，新石器时代（约公元前4000年）
1989年芮城县金胜庄村出土，是仰韶文化庙底沟类型的典型遗物
二、夏商踪迹
在中国上古传说中，尧、舜、禹都在山西地区建立过都城，夏文化更是在这里留下了超过160处遗址。殷商时期，山西分布有众多方国，出土青铜器带有典型的北方草原民族文化特色。
虎饰匕形器，商晚期
1959年石楼县桃花者村出土，方国青铜器，虎目嵌绿松石
三、晋国霸业
公元前1033年，周成王将「唐国」（现曲村-天马遗址）分封给弟弟叔虞，后其子改国名为「晋」。晋文公重耳即位后成为春秋五霸之一，侯马盟书、铸铜作坊等考古发现证实了晋国的强盛，直到公元前403年「三家分晋」，同时也代表着战国时代的开始。
四、民族熔炉
山西北通塞外草原，南临中原腹地，是游牧民族和农耕民族的交汇处。公元304年匈奴人刘渊建汉自立，历经五胡十六国，北魏统一后北方又经历五个鲜卑政权。三百年的民族融合之后，隋唐两朝帝王均有鲜卑血统，也奠定了唐代文化多元开放的基调。
役夫俑、陶立驼、陶卧驼，北齐武平元年（570年）
1980年王郭村娄睿墓出土，墓主娄睿是鲜卑人，曾任北齐太尉、大司马
五、佛风遗韵
南北朝时期，佛教开始在中国兴盛，北朝统治者多信仰提倡佛教，迄今山西仍然保存有超过200处石窟寺、摩崖造像和大量单体造像。隋唐以降，汉传佛教日益民族化、世俗化，成为传统社会文化的一部分，也是中国古代雕塑艺术的重要题材。
石刻菩萨头像，北齐
1979年昔阳县静阳村出土，原有彩绘多已剥落
六、戏曲故乡
山西是中国戏曲艺术的发源地之一。宋金时期，杂剧在山西南部兴起，出现了相对固定的角色、服饰、曲目等，透过砖雕、陶俑、壁画等文物仍然可以了解戏曲表演艺术的流行与繁荣。
砖雕吹笛俑、舞蹈俑，金代
1965年襄汾县荆村沟出土，可以看出两者服饰妆扮为配套设计
七、明清晋商
明朝初年，山西商人在边塞地区经营粮、盐，逐步发展为当时最重要的商帮之一。清道光初年，晋商在平遥县创建了中国第一家票号「日昇昌」，到光绪中期业务已遍及全国，年汇兑白银总额达3000万两。清朝覆灭后晋商也迅速消亡。
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