澳门博物馆共设有3个常设展，分别为澳门的早期历史、澳门民间艺术与传统、当代澳门，专注展示澳门历史与多元文化。
「澳门的早期历史」位于1层展厅，介绍澳门早期历史、中国人与葡萄牙人在澳门的贸易、宗教与文化方面的接触，以及逐渐形成的澳门文化。
夹砂刻画纹口沿，新石器时代，澳门路环黑沙出土
「澳门民间艺术与传统」位于2层展厅，从不同侧面展示澳门的传统文化和民间艺术，再现昔日澳门民间日常生活，尤其是澳门人的休闲娱乐、宗教仪式和民俗庆典。
「当代澳门」位于3层展厅，展示目前澳门的城市面貌和城市生活的特色，同时介绍以澳门为题材的文学作品和艺术作品。
《黄山旧游图》，张大千，1938年
其他展品
摇篮（以木架编藤制造，具有南方民间家具特色）
印有「中国人应用中国货」字样的三角牌，澳门昌明火柴厂造
《雪泥鸿爪》，高剑父，1941年
部分展厅
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